Cet impôt, a priori simple car neutre pour les entreprises, est pourtant source de nombreux redressements basés essentiellement sur le non respect du formalisme,  notamment pour les opérations intra-communautaires, particulièrement surveillées. L’Administration fiscale se montre très stricte dans ce domaine. La vigilance est de mise sur la forme à adopter ou sur les factures reçues, et en cas de contentieux, il peut être opportun d’invoquer la dernière jurisprudence, notamment au niveau communautaire, souvent favorable au contribuable.